Yo hace un mes que tengo la HDR-PJ650VE. En mp4 no he grabado aún y no te puedo ayudar, pero cuando grabo con mi móvil en mp4 si es verdad que la imagen se ve quemada como tu dices, luego creo que será normal ya que la calidad es inferior a los avchd.
En cuanto a la segunda pregunta creo que sí, que la resolución máxima a la que te deja hacer fotos cuando grabas es esa porque en 50i o 50p seguro que no te deja. En el manual viene explicado ese asunto.
Y en torno a la tercera pregunta, a veces he notado eso que comentas de los objetos rallados, pero cuando edito los vídeos después no los veo. Yo creo que es algo del entrelazado cuando grabas a 50i porque sí grabas en 50p al ser progresivo no se nota tanto.
Espero haberte ayudado.